DNA barcoding of penaeidae (Decapoda; crustacea): Non-distance-based species delimitation of the most economically important shrimp family

La familia Penaeidae incluye algunos de los camarones marinos de mayor importancia económica y ecológica, con cientos de especies. A pesar de su importancia y diversidad, la clasificación taxonómica de los camarones peneidos se ha revisado constantemente, y los problemas relacionados con la identificación de especies son comunes. En este estudio, implementamos análisis de códigos de barras de ADN, además de análisis de delimitación de especies de un solo gen, para identificar unidades taxonómicas operativas moleculares (MOTU) y generar información molecular robusta para los camarones peneidos con base en el gen mitocondrial de la subunidad I de la citocromo oxidasa (COI). Nuestro conjunto de datos final incluye secuencias de COI de 112 taxones distribuidos en 23 géneros de peneidos. Empleamos el modelo general mixto de coalescencia de Yule (GMYC), los procesos de árbol de Poisson (PTP) y el modelo bayesiano de PTP (bPTP) para la delimitación de las MOTU. También se calcularon las distancias genéticas intraespecíficas e interespecíficas. Nuestros hallazgos evidenciaron un alto nivel de diversidad oculta, mostrando 143 MOTU, con 27 especies nominales que no concuerdan con la delimitación genética obtenida. Estos datos representan posibles nuevas especies o poblaciones altamente estructuradas, lo que demuestra la importancia de incluir un enfoque de delimitación de especies no basado en la distancia en los estudios de biodiversidad. Los resultados de este estudio arrojan luz sobre la biodiversidad de Penaeidae, abordando importantes cuestiones de taxonomía y etiquetado incorrecto en bases de datos, y contribuyendo a una mejor comprensión del grupo, lo cual sin duda puede contribuir a las políticas de gestión de la actividad pesquera del camarón, además de a los programas de conservación.