TY - JOUR
T1 - DNA barcoding in the Southeast Pacific marine realm
T2 - Low coverage and geographic representation despite high diversity
AU - Ramirez, Jorge L.
AU - Rosas-Puchuri, Ulises
AU - Cañedo, Rosa Maria
AU - Alfaro-Shigueto, Joanna
AU - Ayon, Patricia
AU - Zelada-Mázmela, Eliana
AU - Siccha-Ramirez, Raquel
AU - Velez-Zuazo, Ximena
N1 - Publisher Copyright:
© 2020 Ramirez et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
PY - 2020/12
Y1 - 2020/12
N2 - El Pacífico Sudeste comprende dos Grandes Ecosistemas Marinos, la Costa del Pacífico Centroamericano y el Sistema de la Corriente de Humboldt; y es uno de los menos conocidos en las subregiones tropicales en términos de biodiversidad. Para abordar esto, comparamos repositorios de códigos de barras de ADN con las especies de biodiversidad marina para el Pacífico Sudeste. Obtuvimos una lista de verificación de especies marinas en el Pacífico Sudeste (es decir, Colombia, Ecuador, Chile y Perú) de la base de datos del Sistema de Información sobre Biodiversidad Oceánica (OBIS) y la comparamos con las especies disponibles en el repositorio del Sistema de Datos de Codificación de la Vida (BOLD). De los 5504 registros de especies recuperados de OBIS, el 42% de ellos tenía al menos un espécimen registrado en BOLD (incluyendo especímenes de todo el mundo); sin embargo, solo el 4,5% de los registros correspondían a códigos de barras de ADN disponibles públicamente, incluyendo especímenes recolectados de un país del Pacífico Sudeste. La baja representación de especies con código de barras no varía mucho entre los diferentes grupos taxonómicos o dentro de los países, pero observamos una distribución asimétrica de los registros de código de barras de ADN para los grupos taxonómicos a lo largo de la costa, siendo más abundante para el sistema de la corriente de Humboldt que para la costa del Pacífico centroamericano. Observamos un alto nivel de registros de código de barras con incongruencias en el número de índice de código de barras (BIN), particularmente para peces (Actinopterygii = 30,27% y Elasmobranchii = 24,71%), lo que refleja incertidumbres taxonómicas para peces, mientras que para invertebrados y mamíferos, más del 85% de los registros se clasificaron como con datos deficientes o procedimiento inadecuado para el código de barras de ADN. El código de barras de ADN es una herramienta poderosa para estudiar la biodiversidad, con un gran potencial para aumentar el conocimiento de la biodiversidad marina del Pacífico sudoriental. Nuestros resultados resaltan la necesidad crítica de aumentar el esfuerzo de muestreo taxonómico, el número de especialistas taxonómicos capacitados, las instalaciones de laboratorio, las colecciones científicas y las bibliotecas de referencia genética.
AB - El Pacífico Sudeste comprende dos Grandes Ecosistemas Marinos, la Costa del Pacífico Centroamericano y el Sistema de la Corriente de Humboldt; y es uno de los menos conocidos en las subregiones tropicales en términos de biodiversidad. Para abordar esto, comparamos repositorios de códigos de barras de ADN con las especies de biodiversidad marina para el Pacífico Sudeste. Obtuvimos una lista de verificación de especies marinas en el Pacífico Sudeste (es decir, Colombia, Ecuador, Chile y Perú) de la base de datos del Sistema de Información sobre Biodiversidad Oceánica (OBIS) y la comparamos con las especies disponibles en el repositorio del Sistema de Datos de Codificación de la Vida (BOLD). De los 5504 registros de especies recuperados de OBIS, el 42% de ellos tenía al menos un espécimen registrado en BOLD (incluyendo especímenes de todo el mundo); sin embargo, solo el 4,5% de los registros correspondían a códigos de barras de ADN disponibles públicamente, incluyendo especímenes recolectados de un país del Pacífico Sudeste. La baja representación de especies con código de barras no varía mucho entre los diferentes grupos taxonómicos o dentro de los países, pero observamos una distribución asimétrica de los registros de código de barras de ADN para los grupos taxonómicos a lo largo de la costa, siendo más abundante para el sistema de la corriente de Humboldt que para la costa del Pacífico centroamericano. Observamos un alto nivel de registros de código de barras con incongruencias en el número de índice de código de barras (BIN), particularmente para peces (Actinopterygii = 30,27% y Elasmobranchii = 24,71%), lo que refleja incertidumbres taxonómicas para peces, mientras que para invertebrados y mamíferos, más del 85% de los registros se clasificaron como con datos deficientes o procedimiento inadecuado para el código de barras de ADN. El código de barras de ADN es una herramienta poderosa para estudiar la biodiversidad, con un gran potencial para aumentar el conocimiento de la biodiversidad marina del Pacífico sudoriental. Nuestros resultados resaltan la necesidad crítica de aumentar el esfuerzo de muestreo taxonómico, el número de especialistas taxonómicos capacitados, las instalaciones de laboratorio, las colecciones científicas y las bibliotecas de referencia genética.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85098914522&partnerID=8YFLogxK
U2 - 10.1371/journal.pone.0244323
DO - 10.1371/journal.pone.0244323
M3 - Artículo
C2 - 33370342
AN - SCOPUS:85098914522
SN - 1932-6203
VL - 15
JO - PLoS ONE
JF - PLoS ONE
IS - 12 December
M1 - e0244323
ER -